Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk7Q03147 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk7Q03147 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk7Q03147 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk7Q03147 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk7Q03147 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk7Q03147 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk7Q03147 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk7Q03147 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk7Q03147 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk7Q03147 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk7Q03147 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk7Q03147 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk7Q03147 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk7Q03147 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk7Q03147 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk7Q03147 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk7Q03147 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk7Q03147 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk7Q03147 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk7Q03147 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk7Q03147 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk7Q03147 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk7Q03147 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk7Q03147 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk7Q03147 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk7Q03147 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk7Q03147 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk7Q03147 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk7Q03147 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk7Q03147 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk7Q03147 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk7Q03147 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk7Q03147 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk7Q03147 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk7Q03147 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk7Q03147 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk7Q03147 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk7Q03147 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk7Q03147 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk7Q03147 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk7Q03147 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk7Q03147 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk7Q03147 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk7Q03147 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk7Q03147 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk7Q03147 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk7Q03147 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk7Q03147 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk7Q03147 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk7Q03147 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk7Q03147 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk7Q03147 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk7Q03147 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk7Q03147 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk7Q03147 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk7Q03147 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk7Q03147 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk7Q03147 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk7Q03147 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk7Q03147 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.3 ms