Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pax5Q02650 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pax5Q02650 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pax5Q02650 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pax5Q02650 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pax5Q02650 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pax5Q02650 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pax5Q02650 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pax5Q02650 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pax5Q02650 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pax5Q02650 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pax5Q02650 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pax5Q02650 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pax5Q02650 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pax5Q02650 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pax5Q02650 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pax5Q02650 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pax5Q02650 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pax5Q02650 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pax5Q02650 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pax5Q02650 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pax5Q02650 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pax5Q02650 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pax5Q02650 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pax5Q02650 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pax5Q02650 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pax5Q02650 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pax5Q02650 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pax5Q02650 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pax5Q02650 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pax5Q02650 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pax5Q02650 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pax5Q02650 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pax5Q02650 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pax5Q02650 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pax5Q02650 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pax5Q02650 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pax5Q02650 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pax5Q02650 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pax5Q02650 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pax5Q02650 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pax5Q02650 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pax5Q02650 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms