Protein–RNA interactions for Protein: Q01730

Rsu1, Ras suppressor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsu1Q01730 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rsu1Q01730 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsu1Q01730 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsu1Q01730 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsu1Q01730 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsu1Q01730 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsu1Q01730 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsu1Q01730 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsu1Q01730 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsu1Q01730 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsu1Q01730 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsu1Q01730 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rsu1Q01730 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rsu1Q01730 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rsu1Q01730 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rsu1Q01730 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rsu1Q01730 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rsu1Q01730 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rsu1Q01730 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rsu1Q01730 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rsu1Q01730 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rsu1Q01730 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rsu1Q01730 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rsu1Q01730 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rsu1Q01730 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rsu1Q01730 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rsu1Q01730 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rsu1Q01730 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rsu1Q01730 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rsu1Q01730 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rsu1Q01730 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rsu1Q01730 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rsu1Q01730 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rsu1Q01730 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rsu1Q01730 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsu1Q01730 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms