Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gjb2Q00977 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gjb2Q00977 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gjb2Q00977 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gjb2Q00977 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gjb2Q00977 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gjb2Q00977 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gjb2Q00977 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gjb2Q00977 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gjb2Q00977 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gjb2Q00977 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gjb2Q00977 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Gjb2Q00977 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gjb2Q00977 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gjb2Q00977 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gjb2Q00977 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gjb2Q00977 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Gjb2Q00977 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gjb2Q00977 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gjb2Q00977 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gjb2Q00977 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gjb2Q00977 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gjb2Q00977 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gjb2Q00977 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gjb2Q00977 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gjb2Q00977 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gjb2Q00977 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gjb2Q00977 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gjb2Q00977 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gjb2Q00977 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gjb2Q00977 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gjb2Q00977 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gjb2Q00977 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Gjb2Q00977 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gjb2Q00977 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gjb2Q00977 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gjb2Q00977 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gjb2Q00977 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gjb2Q00977 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gjb2Q00977 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gjb2Q00977 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gjb2Q00977 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gjb2Q00977 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gjb2Q00977 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gjb2Q00977 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gjb2Q00977 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gjb2Q00977 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gjb2Q00977 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gjb2Q00977 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gjb2Q00977 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gjb2Q00977 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gjb2Q00977 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gjb2Q00977 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gjb2Q00977 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gjb2Q00977 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gjb2Q00977 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gjb2Q00977 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gjb2Q00977 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gjb2Q00977 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gjb2Q00977 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gjb2Q00977 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gjb2Q00977 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gjb2Q00977 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gjb2Q00977 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gjb2Q00977 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gjb2Q00977 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gjb2Q00977 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gjb2Q00977 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gjb2Q00977 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gjb2Q00977 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gjb2Q00977 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gjb2Q00977 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gjb2Q00977 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gjb2Q00977 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Gjb2Q00977 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gjb2Q00977 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gjb2Q00977 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gjb2Q00977 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gjb2Q00977 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gjb2Q00977 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gjb2Q00977 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gjb2Q00977 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gjb2Q00977 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gjb2Q00977 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gjb2Q00977 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gjb2Q00977 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gjb2Q00977 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gjb2Q00977 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Gjb2Q00977 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gjb2Q00977 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gjb2Q00977 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gjb2Q00977 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gjb2Q00977 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Gjb2Q00977 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gjb2Q00977 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gjb2Q00977 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gjb2Q00977 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gjb2Q00977 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gjb2Q00977 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gjb2Q00977 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms