Protein–RNA interactions for Protein: P97454

Smad5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad5P97454 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad5P97454 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad5P97454 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad5P97454 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smad5P97454 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad5P97454 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad5P97454 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smad5P97454 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad5P97454 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad5P97454 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad5P97454 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad5P97454 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smad5P97454 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad5P97454 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad5P97454 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad5P97454 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smad5P97454 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smad5P97454 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smad5P97454 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smad5P97454 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad5P97454 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smad5P97454 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad5P97454 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad5P97454 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smad5P97454 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad5P97454 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smad5P97454 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad5P97454 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad5P97454 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smad5P97454 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad5P97454 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smad5P97454 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad5P97454 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad5P97454 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad5P97454 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad5P97454 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smad5P97454 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad5P97454 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smad5P97454 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smad5P97454 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smad5P97454 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad5P97454 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smad5P97454 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smad5P97454 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms