Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RptnP97347 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RptnP97347 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RptnP97347 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RptnP97347 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RptnP97347 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RptnP97347 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RptnP97347 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RptnP97347 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RptnP97347 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RptnP97347 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RptnP97347 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RptnP97347 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RptnP97347 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RptnP97347 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RptnP97347 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RptnP97347 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RptnP97347 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RptnP97347 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RptnP97347 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RptnP97347 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RptnP97347 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RptnP97347 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RptnP97347 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RptnP97347 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RptnP97347 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RptnP97347 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RptnP97347 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RptnP97347 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RptnP97347 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RptnP97347 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RptnP97347 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RptnP97347 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RptnP97347 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RptnP97347 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RptnP97347 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RptnP97347 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RptnP97347 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RptnP97347 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RptnP97347 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RptnP97347 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RptnP97347 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RptnP97347 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RptnP97347 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RptnP97347 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RptnP97347 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RptnP97347 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RptnP97347 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RptnP97347 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RptnP97347 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RptnP97347 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RptnP97347 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RptnP97347 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RptnP97347 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RptnP97347 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RptnP97347 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RptnP97347 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RptnP97347 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RptnP97347 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RptnP97347 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RptnP97347 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RptnP97347 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RptnP97347 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RptnP97347 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RptnP97347 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RptnP97347 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RptnP97347 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RptnP97347 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RptnP97347 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RptnP97347 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RptnP97347 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RptnP97347 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RptnP97347 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RptnP97347 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RptnP97347 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RptnP97347 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RptnP97347 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RptnP97347 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RptnP97347 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RptnP97347 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RptnP97347 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RptnP97347 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RptnP97347 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RptnP97347 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RptnP97347 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RptnP97347 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RptnP97347 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RptnP97347 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RptnP97347 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RptnP97347 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RptnP97347 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RptnP97347 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RptnP97347 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RptnP97347 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RptnP97347 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RptnP97347 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RptnP97347 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RptnP97347 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RptnP97347 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RptnP97347 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms