Protein–RNA interactions for Protein: P70326

Tbx5, T-box transcription factor TBX5, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx5P70326 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbx5P70326 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tbx5P70326 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbx5P70326 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbx5P70326 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tbx5P70326 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbx5P70326 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbx5P70326 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbx5P70326 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbx5P70326 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tbx5P70326 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbx5P70326 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbx5P70326 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbx5P70326 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tbx5P70326 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tbx5P70326 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tbx5P70326 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbx5P70326 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tbx5P70326 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbx5P70326 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbx5P70326 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbx5P70326 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tbx5P70326 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbx5P70326 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbx5P70326 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbx5P70326 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbx5P70326 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbx5P70326 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx5P70326 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx5P70326 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbx5P70326 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx5P70326 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx5P70326 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx5P70326 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbx5P70326 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbx5P70326 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx5P70326 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx5P70326 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbx5P70326 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbx5P70326 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tbx5P70326 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbx5P70326 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbx5P70326 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbx5P70326 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbx5P70326 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbx5P70326 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tbx5P70326 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbx5P70326 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tbx5P70326 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbx5P70326 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbx5P70326 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tbx5P70326 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbx5P70326 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbx5P70326 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbx5P70326 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tbx5P70326 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tbx5P70326 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tbx5P70326 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tbx5P70326 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tbx5P70326 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tbx5P70326 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tbx5P70326 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tbx5P70326 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tbx5P70326 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tbx5P70326 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tbx5P70326 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tbx5P70326 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tbx5P70326 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tbx5P70326 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tbx5P70326 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tbx5P70326 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tbx5P70326 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tbx5P70326 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tbx5P70326 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tbx5P70326 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tbx5P70326 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tbx5P70326 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tbx5P70326 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tbx5P70326 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tbx5P70326 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tbx5P70326 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tbx5P70326 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms