Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rad54lP70270 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rad54lP70270 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rad54lP70270 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rad54lP70270 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rad54lP70270 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rad54lP70270 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad54lP70270 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad54lP70270 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad54lP70270 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rad54lP70270 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rad54lP70270 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad54lP70270 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad54lP70270 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad54lP70270 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad54lP70270 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rad54lP70270 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rad54lP70270 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rad54lP70270 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad54lP70270 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad54lP70270 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad54lP70270 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rad54lP70270 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rad54lP70270 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rad54lP70270 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad54lP70270 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rad54lP70270 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad54lP70270 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad54lP70270 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad54lP70270 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad54lP70270 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rad54lP70270 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad54lP70270 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad54lP70270 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad54lP70270 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad54lP70270 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad54lP70270 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad54lP70270 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad54lP70270 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad54lP70270 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad54lP70270 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad54lP70270 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad54lP70270 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad54lP70270 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad54lP70270 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rad54lP70270 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad54lP70270 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad54lP70270 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad54lP70270 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad54lP70270 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rad54lP70270 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rad54lP70270 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad54lP70270 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rad54lP70270 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad54lP70270 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad54lP70270 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad54lP70270 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad54lP70270 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad54lP70270 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad54lP70270 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad54lP70270 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rad54lP70270 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rad54lP70270 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rad54lP70270 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rad54lP70270 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rad54lP70270 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rad54lP70270 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad54lP70270 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad54lP70270 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rad54lP70270 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad54lP70270 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad54lP70270 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad54lP70270 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad54lP70270 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad54lP70270 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad54lP70270 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad54lP70270 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rad54lP70270 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad54lP70270 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.2 ms