Protein–RNA interactions for Protein: P70206

Plxna1, Plexin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 1,894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna1P70206 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Plxna1P70206 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Plxna1P70206 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plxna1P70206 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Plxna1P70206 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plxna1P70206 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plxna1P70206 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plxna1P70206 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plxna1P70206 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Plxna1P70206 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plxna1P70206 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plxna1P70206 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Plxna1P70206 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Plxna1P70206 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Plxna1P70206 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Plxna1P70206 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Plxna1P70206 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plxna1P70206 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plxna1P70206 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plxna1P70206 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Plxna1P70206 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Plxna1P70206 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Plxna1P70206 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Plxna1P70206 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Plxna1P70206 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Plxna1P70206 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Plxna1P70206 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Plxna1P70206 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Plxna1P70206 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Plxna1P70206 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Plxna1P70206 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Plxna1P70206 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Plxna1P70206 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Plxna1P70206 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Plxna1P70206 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Plxna1P70206 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Plxna1P70206 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Plxna1P70206 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Plxna1P70206 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Plxna1P70206 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Plxna1P70206 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Plxna1P70206 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Plxna1P70206 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Plxna1P70206 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Plxna1P70206 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Plxna1P70206 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Plxna1P70206 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Plxna1P70206 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Plxna1P70206 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Plxna1P70206 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Plxna1P70206 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Plxna1P70206 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Plxna1P70206 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Plxna1P70206 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Plxna1P70206 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Plxna1P70206 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Plxna1P70206 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Plxna1P70206 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Plxna1P70206 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Plxna1P70206 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Plxna1P70206 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Plxna1P70206 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Plxna1P70206 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Plxna1P70206 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Plxna1P70206 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Plxna1P70206 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Plxna1P70206 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Plxna1P70206 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Plxna1P70206 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Plxna1P70206 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Plxna1P70206 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Plxna1P70206 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Plxna1P70206 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Plxna1P70206 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Plxna1P70206 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Plxna1P70206 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Plxna1P70206 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Plxna1P70206 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Plxna1P70206 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Plxna1P70206 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Plxna1P70206 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Plxna1P70206 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms