Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnab1P63143 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnab1P63143 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnab1P63143 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnab1P63143 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnab1P63143 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnab1P63143 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnab1P63143 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnab1P63143 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnab1P63143 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnab1P63143 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnab1P63143 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnab1P63143 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnab1P63143 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnab1P63143 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnab1P63143 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnab1P63143 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnab1P63143 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnab1P63143 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kcnab1P63143 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnab1P63143 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnab1P63143 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kcnab1P63143 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnab1P63143 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kcnab1P63143 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnab1P63143 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kcnab1P63143 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnab1P63143 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnab1P63143 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnab1P63143 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kcnab1P63143 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnab1P63143 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kcnab1P63143 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnab1P63143 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnab1P63143 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kcnab1P63143 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnab1P63143 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kcnab1P63143 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnab1P63143 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kcnab1P63143 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnab1P63143 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnab1P63143 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kcnab1P63143 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kcnab1P63143 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnab1P63143 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kcnab1P63143 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnab1P63143 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnab1P63143 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnab1P63143 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnab1P63143 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnab1P63143 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kcnab1P63143 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kcnab1P63143 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kcnab1P63143 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnab1P63143 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kcnab1P63143 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnab1P63143 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnab1P63143 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnab1P63143 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms