Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gabrb3P63080 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gabrb3P63080 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gabrb3P63080 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gabrb3P63080 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gabrb3P63080 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gabrb3P63080 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gabrb3P63080 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gabrb3P63080 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabrb3P63080 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabrb3P63080 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabrb3P63080 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gabrb3P63080 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gabrb3P63080 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gabrb3P63080 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gabrb3P63080 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gabrb3P63080 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gabrb3P63080 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gabrb3P63080 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gabrb3P63080 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabrb3P63080 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabrb3P63080 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabrb3P63080 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabrb3P63080 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabrb3P63080 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gabrb3P63080 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabrb3P63080 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabrb3P63080 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabrb3P63080 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabrb3P63080 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gabrb3P63080 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gabrb3P63080 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gabrb3P63080 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabrb3P63080 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabrb3P63080 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gabrb3P63080 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gabrb3P63080 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gabrb3P63080 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gabrb3P63080 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gabrb3P63080 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gabrb3P63080 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabrb3P63080 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabrb3P63080 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabrb3P63080 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabrb3P63080 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabrb3P63080 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabrb3P63080 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabrb3P63080 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabrb3P63080 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabrb3P63080 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabrb3P63080 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabrb3P63080 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabrb3P63080 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabrb3P63080 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabrb3P63080 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabrb3P63080 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabrb3P63080 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabrb3P63080 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabrb3P63080 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms