Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpd3P62320 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snrpd3P62320 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd3P62320 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd3P62320 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snrpd3P62320 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd3P62320 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd3P62320 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snrpd3P62320 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd3P62320 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Snrpd3P62320 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd3P62320 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Snrpd3P62320 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd3P62320 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpd3P62320 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpd3P62320 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd3P62320 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snrpd3P62320 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms