Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lsm3P62311 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lsm3P62311 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lsm3P62311 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lsm3P62311 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lsm3P62311 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lsm3P62311 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Lsm3P62311 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsm3P62311 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsm3P62311 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsm3P62311 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms