Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp46P62069 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp46P62069 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp46P62069 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp46P62069 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp46P62069 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp46P62069 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp46P62069 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp46P62069 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp46P62069 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp46P62069 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp46P62069 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp46P62069 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp46P62069 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp46P62069 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp46P62069 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp46P62069 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp46P62069 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp46P62069 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp46P62069 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp46P62069 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp46P62069 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp46P62069 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp46P62069 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp46P62069 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp46P62069 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp46P62069 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp46P62069 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp46P62069 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp46P62069 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp46P62069 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp46P62069 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp46P62069 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp46P62069 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp46P62069 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp46P62069 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp46P62069 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp46P62069 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp46P62069 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp46P62069 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp46P62069 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp46P62069 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp46P62069 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp46P62069 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp46P62069 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp46P62069 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp46P62069 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp46P62069 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp46P62069 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp46P62069 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp46P62069 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp46P62069 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp46P62069 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp46P62069 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp46P62069 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp46P62069 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp46P62069 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp46P62069 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp46P62069 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp46P62069 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp46P62069 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp46P62069 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp46P62069 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp46P62069 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp46P62069 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp46P62069 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp46P62069 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp46P62069 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp46P62069 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp46P62069 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp46P62069 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp46P62069 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp46P62069 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp46P62069 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp46P62069 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp46P62069 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp46P62069 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp46P62069 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp46P62069 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp46P62069 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp46P62069 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp46P62069 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
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