Protein–RNA interactions for Protein: P61979

Hnrnpk, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpkP61979 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HnrnpkP61979 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HnrnpkP61979 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HnrnpkP61979 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HnrnpkP61979 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HnrnpkP61979 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HnrnpkP61979 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HnrnpkP61979 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HnrnpkP61979 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HnrnpkP61979 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HnrnpkP61979 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HnrnpkP61979 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HnrnpkP61979 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HnrnpkP61979 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HnrnpkP61979 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HnrnpkP61979 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HnrnpkP61979 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HnrnpkP61979 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HnrnpkP61979 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HnrnpkP61979 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HnrnpkP61979 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HnrnpkP61979 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HnrnpkP61979 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HnrnpkP61979 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HnrnpkP61979 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HnrnpkP61979 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HnrnpkP61979 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HnrnpkP61979 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HnrnpkP61979 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HnrnpkP61979 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HnrnpkP61979 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpkP61979 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpkP61979 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HnrnpkP61979 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HnrnpkP61979 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HnrnpkP61979 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HnrnpkP61979 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HnrnpkP61979 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HnrnpkP61979 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HnrnpkP61979 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HnrnpkP61979 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HnrnpkP61979 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HnrnpkP61979 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HnrnpkP61979 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HnrnpkP61979 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HnrnpkP61979 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HnrnpkP61979 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HnrnpkP61979 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HnrnpkP61979 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HnrnpkP61979 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HnrnpkP61979 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HnrnpkP61979 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HnrnpkP61979 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HnrnpkP61979 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HnrnpkP61979 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HnrnpkP61979 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HnrnpkP61979 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HnrnpkP61979 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HnrnpkP61979 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HnrnpkP61979 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HnrnpkP61979 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HnrnpkP61979 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HnrnpkP61979 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HnrnpkP61979 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HnrnpkP61979 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HnrnpkP61979 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HnrnpkP61979 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HnrnpkP61979 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HnrnpkP61979 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HnrnpkP61979 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HnrnpkP61979 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HnrnpkP61979 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HnrnpkP61979 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HnrnpkP61979 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HnrnpkP61979 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HnrnpkP61979 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HnrnpkP61979 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HnrnpkP61979 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HnrnpkP61979 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms