Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ufm1P61961 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ufm1P61961 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ufm1P61961 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ufm1P61961 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ufm1P61961 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufm1P61961 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ufm1P61961 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ufm1P61961 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ufm1P61961 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ufm1P61961 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufm1P61961 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufm1P61961 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ufm1P61961 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ufm1P61961 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ufm1P61961 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ufm1P61961 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ufm1P61961 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ufm1P61961 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ufm1P61961 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ufm1P61961 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ufm1P61961 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ufm1P61961 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ufm1P61961 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ufm1P61961 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ufm1P61961 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ufm1P61961 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ufm1P61961 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ufm1P61961 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ufm1P61961 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufm1P61961 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufm1P61961 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ufm1P61961 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ufm1P61961 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ufm1P61961 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ufm1P61961 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufm1P61961 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufm1P61961 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ufm1P61961 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ufm1P61961 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ufm1P61961 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ufm1P61961 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ufm1P61961 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ufm1P61961 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ufm1P61961 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufm1P61961 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufm1P61961 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufm1P61961 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufm1P61961 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ufm1P61961 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ufm1P61961 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ufm1P61961 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ufm1P61961 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms