Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SnnP61807 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SnnP61807 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnnP61807 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnnP61807 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SnnP61807 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SnnP61807 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnnP61807 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnnP61807 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnnP61807 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SnnP61807 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnnP61807 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnnP61807 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnnP61807 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnnP61807 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnnP61807 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnnP61807 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SnnP61807 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnnP61807 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnnP61807 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnnP61807 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnnP61807 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnnP61807 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SnnP61807 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SnnP61807 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SnnP61807 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnnP61807 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnnP61807 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnnP61807 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnnP61807 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnnP61807 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnnP61807 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnnP61807 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnnP61807 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnnP61807 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnnP61807 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnnP61807 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnnP61807 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnnP61807 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnnP61807 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnnP61807 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnnP61807 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnnP61807 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnnP61807 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnnP61807 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnnP61807 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnnP61807 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnnP61807 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnnP61807 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnnP61807 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnnP61807 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnnP61807 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnnP61807 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SnnP61807 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SnnP61807 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnnP61807 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SnnP61807 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SnnP61807 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnnP61807 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnnP61807 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnnP61807 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnnP61807 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnnP61807 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnnP61807 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnnP61807 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnnP61807 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnnP61807 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnnP61807 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnnP61807 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnnP61807 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnnP61807 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnnP61807 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnnP61807 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnnP61807 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnnP61807 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnnP61807 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnnP61807 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnnP61807 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnnP61807 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnnP61807 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnnP61807 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnnP61807 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnnP61807 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnnP61807 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnnP61807 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnnP61807 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnnP61807 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnnP61807 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnnP61807 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnnP61807 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnnP61807 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnnP61807 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SnnP61807 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnnP61807 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnnP61807 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnnP61807 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnnP61807 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnnP61807 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnnP61807 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnnP61807 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms