Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vbp1P61759 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vbp1P61759 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vbp1P61759 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vbp1P61759 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vbp1P61759 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.2 ms