Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Eif3eP60229 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Eif3eP60229 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Eif3eP60229 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Eif3eP60229 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Eif3eP60229 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eif3eP60229 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Eif3eP60229 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eif3eP60229 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eif3eP60229 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Eif3eP60229 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eif3eP60229 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eif3eP60229 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif3eP60229 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif3eP60229 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif3eP60229 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif3eP60229 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif3eP60229 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3eP60229 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3eP60229 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Eif3eP60229 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Eif3eP60229 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Eif3eP60229 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Eif3eP60229 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eif3eP60229 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Eif3eP60229 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eif3eP60229 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eif3eP60229 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Eif3eP60229 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Eif3eP60229 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif3eP60229 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif3eP60229 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif3eP60229 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif3eP60229 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif3eP60229 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif3eP60229 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Eif3eP60229 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif3eP60229 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif3eP60229 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Eif3eP60229 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Eif3eP60229 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3eP60229 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Eif3eP60229 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3eP60229 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3eP60229 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3eP60229 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3eP60229 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Eif3eP60229 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3eP60229 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3eP60229 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3eP60229 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Eif3eP60229 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eif3eP60229 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eif3eP60229 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eif3eP60229 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eif3eP60229 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eif3eP60229 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Eif3eP60229 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eif3eP60229 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eif3eP60229 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eif3eP60229 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eif3eP60229 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eif3eP60229 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eif3eP60229 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eif3eP60229 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eif3eP60229 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eif3eP60229 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eif3eP60229 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eif3eP60229 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3eP60229 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3eP60229 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3eP60229 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3eP60229 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eif3eP60229 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eif3eP60229 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eif3eP60229 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eif3eP60229 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Eif3eP60229 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eif3eP60229 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eif3eP60229 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms