Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Kdm2aP59997 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Kdm2aP59997 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm2aP59997 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm2aP59997 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm2aP59997 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm2aP59997 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm2aP59997 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm2aP59997 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm2aP59997 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Kdm2aP59997 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Kdm2aP59997 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Kdm2aP59997 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Kdm2aP59997 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm2aP59997 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Kdm2aP59997 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Kdm2aP59997 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Kdm2aP59997 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Kdm2aP59997 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Kdm2aP59997 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kdm2aP59997 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Kdm2aP59997 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Kdm2aP59997 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Kdm2aP59997 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm2aP59997 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm2aP59997 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm2aP59997 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm2aP59997 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Kdm2aP59997 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Kdm2aP59997 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Kdm2aP59997 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm2aP59997 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm2aP59997 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm2aP59997 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm2aP59997 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm2aP59997 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Kdm2aP59997 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm2aP59997 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm2aP59997 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm2aP59997 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm2aP59997 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm2aP59997 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm2aP59997 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm2aP59997 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Kdm2aP59997 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm2aP59997 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm2aP59997 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Kdm2aP59997 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm2aP59997 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm2aP59997 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm2aP59997 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm2aP59997 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm2aP59997 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm2aP59997 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Kdm2aP59997 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Kdm2aP59997 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Kdm2aP59997 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm2aP59997 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kdm2aP59997 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Kdm2aP59997 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Kdm2aP59997 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Kdm2aP59997 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Kdm2aP59997 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Kdm2aP59997 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Kdm2aP59997 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Kdm2aP59997 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Kdm2aP59997 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Kdm2aP59997 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Kdm2aP59997 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Kdm2aP59997 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Kdm2aP59997 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm2aP59997 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm2aP59997 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm2aP59997 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Kdm2aP59997 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm2aP59997 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm2aP59997 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Kdm2aP59997 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Kdm2aP59997 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Kdm2aP59997 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm2aP59997 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm2aP59997 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Kdm2aP59997 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm2aP59997 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm2aP59997 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Kdm2aP59997 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm2aP59997 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Kdm2aP59997 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
Kdm2aP59997 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Kdm2aP59997 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm2aP59997 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Kdm2aP59997 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Kdm2aP59997 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Kdm2aP59997 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm2aP59997 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Kdm2aP59997 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm2aP59997 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm2aP59997 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm2aP59997 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Kdm2aP59997 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms