Protein–RNA interactions for Protein: P59672

Anks1a, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks1aP59672 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Anks1aP59672 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Anks1aP59672 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Anks1aP59672 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Anks1aP59672 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Anks1aP59672 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Anks1aP59672 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Anks1aP59672 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Anks1aP59672 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Anks1aP59672 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Anks1aP59672 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Anks1aP59672 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Anks1aP59672 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Anks1aP59672 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Anks1aP59672 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Anks1aP59672 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Anks1aP59672 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Anks1aP59672 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Anks1aP59672 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Anks1aP59672 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Anks1aP59672 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Anks1aP59672 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Anks1aP59672 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Anks1aP59672 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Anks1aP59672 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Anks1aP59672 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Anks1aP59672 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Anks1aP59672 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Anks1aP59672 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Anks1aP59672 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Anks1aP59672 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Anks1aP59672 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Anks1aP59672 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Anks1aP59672 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Anks1aP59672 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Anks1aP59672 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Anks1aP59672 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Anks1aP59672 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Anks1aP59672 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Anks1aP59672 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Anks1aP59672 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Anks1aP59672 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Anks1aP59672 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Anks1aP59672 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Anks1aP59672 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Anks1aP59672 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Anks1aP59672 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Anks1aP59672 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Anks1aP59672 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Anks1aP59672 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Anks1aP59672 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Anks1aP59672 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Anks1aP59672 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Anks1aP59672 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Anks1aP59672 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Anks1aP59672 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Anks1aP59672 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Anks1aP59672 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Anks1aP59672 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Anks1aP59672 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Anks1aP59672 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Anks1aP59672 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Anks1aP59672 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Anks1aP59672 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Anks1aP59672 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Anks1aP59672 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Anks1aP59672 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Anks1aP59672 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Anks1aP59672 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Anks1aP59672 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Anks1aP59672 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Anks1aP59672 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Anks1aP59672 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Anks1aP59672 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Anks1aP59672 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Anks1aP59672 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Anks1aP59672 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Anks1aP59672 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Anks1aP59672 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Anks1aP59672 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Anks1aP59672 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Anks1aP59672 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Anks1aP59672 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Anks1aP59672 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Anks1aP59672 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Anks1aP59672 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Anks1aP59672 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Anks1aP59672 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Anks1aP59672 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Anks1aP59672 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Anks1aP59672 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Anks1aP59672 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Anks1aP59672 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Anks1aP59672 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Anks1aP59672 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Anks1aP59672 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Anks1aP59672 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Anks1aP59672 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Anks1aP59672 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Anks1aP59672 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.1 ms