Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sssca1P56873 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sssca1P56873 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sssca1P56873 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sssca1P56873 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sssca1P56873 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sssca1P56873 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sssca1P56873 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sssca1P56873 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sssca1P56873 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sssca1P56873 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sssca1P56873 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sssca1P56873 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sssca1P56873 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sssca1P56873 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sssca1P56873 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sssca1P56873 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sssca1P56873 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sssca1P56873 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sssca1P56873 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sssca1P56873 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sssca1P56873 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sssca1P56873 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sssca1P56873 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sssca1P56873 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sssca1P56873 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sssca1P56873 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sssca1P56873 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sssca1P56873 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sssca1P56873 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sssca1P56873 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sssca1P56873 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sssca1P56873 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sssca1P56873 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sssca1P56873 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sssca1P56873 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sssca1P56873 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sssca1P56873 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sssca1P56873 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sssca1P56873 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sssca1P56873 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sssca1P56873 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sssca1P56873 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sssca1P56873 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sssca1P56873 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sssca1P56873 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sssca1P56873 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sssca1P56873 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sssca1P56873 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sssca1P56873 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sssca1P56873 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sssca1P56873 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sssca1P56873 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms