Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtskP55097 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CtskP55097 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtskP55097 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtskP55097 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CtskP55097 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtskP55097 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtskP55097 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CtskP55097 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CtskP55097 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtskP55097 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CtskP55097 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CtskP55097 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CtskP55097 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtskP55097 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CtskP55097 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtskP55097 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtskP55097 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtskP55097 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtskP55097 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CtskP55097 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtskP55097 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtskP55097 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtskP55097 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CtskP55097 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtskP55097 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CtskP55097 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CtskP55097 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CtskP55097 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtskP55097 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtskP55097 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CtskP55097 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtskP55097 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CtskP55097 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtskP55097 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtskP55097 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CtskP55097 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtskP55097 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtskP55097 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtskP55097 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtskP55097 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CtskP55097 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtskP55097 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtskP55097 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CtskP55097 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CtskP55097 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtskP55097 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtskP55097 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtskP55097 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtskP55097 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtskP55097 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CtskP55097 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CtskP55097 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtskP55097 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtskP55097 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CtskP55097 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CtskP55097 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtskP55097 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtskP55097 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtskP55097 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CtskP55097 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CtskP55097 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CtskP55097 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CtskP55097 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtskP55097 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtskP55097 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CtskP55097 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtskP55097 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CtskP55097 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtskP55097 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtskP55097 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtskP55097 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtskP55097 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CtskP55097 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtskP55097 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtskP55097 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtskP55097 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtskP55097 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtskP55097 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtskP55097 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtskP55097 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CtskP55097 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtskP55097 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtskP55097 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtskP55097 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtskP55097 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CtskP55097 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtskP55097 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtskP55097 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CtskP55097 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtskP55097 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtskP55097 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtskP55097 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtskP55097 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CtskP55097 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtskP55097 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtskP55097 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtskP55097 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtskP55097 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtskP55097 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms