Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DbtP53395 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DbtP53395 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DbtP53395 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DbtP53395 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DbtP53395 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DbtP53395 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DbtP53395 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DbtP53395 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DbtP53395 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DbtP53395 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DbtP53395 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DbtP53395 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DbtP53395 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DbtP53395 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DbtP53395 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DbtP53395 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DbtP53395 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DbtP53395 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DbtP53395 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DbtP53395 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DbtP53395 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DbtP53395 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DbtP53395 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DbtP53395 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DbtP53395 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DbtP53395 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DbtP53395 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DbtP53395 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DbtP53395 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DbtP53395 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DbtP53395 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DbtP53395 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DbtP53395 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DbtP53395 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DbtP53395 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DbtP53395 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DbtP53395 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DbtP53395 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DbtP53395 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DbtP53395 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DbtP53395 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DbtP53395 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DbtP53395 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DbtP53395 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DbtP53395 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DbtP53395 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DbtP53395 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DbtP53395 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DbtP53395 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DbtP53395 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DbtP53395 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DbtP53395 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DbtP53395 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DbtP53395 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DbtP53395 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DbtP53395 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DbtP53395 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DbtP53395 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DbtP53395 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DbtP53395 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DbtP53395 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DbtP53395 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DbtP53395 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DbtP53395 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DbtP53395 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DbtP53395 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DbtP53395 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DbtP53395 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DbtP53395 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DbtP53395 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DbtP53395 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DbtP53395 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DbtP53395 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DbtP53395 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DbtP53395 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DbtP53395 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DbtP53395 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DbtP53395 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DbtP53395 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DbtP53395 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DbtP53395 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DbtP53395 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DbtP53395 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DbtP53395 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DbtP53395 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DbtP53395 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DbtP53395 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DbtP53395 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DbtP53395 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DbtP53395 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DbtP53395 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DbtP53395 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DbtP53395 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DbtP53395 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DbtP53395 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DbtP53395 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DbtP53395 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DbtP53395 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DbtP53395 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms