Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CcnfP51944 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CcnfP51944 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CcnfP51944 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CcnfP51944 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CcnfP51944 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CcnfP51944 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CcnfP51944 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CcnfP51944 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CcnfP51944 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CcnfP51944 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CcnfP51944 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CcnfP51944 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CcnfP51944 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CcnfP51944 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnfP51944 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnfP51944 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CcnfP51944 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CcnfP51944 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcnfP51944 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcnfP51944 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CcnfP51944 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcnfP51944 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcnfP51944 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcnfP51944 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CcnfP51944 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnfP51944 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnfP51944 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CcnfP51944 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnfP51944 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnfP51944 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnfP51944 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CcnfP51944 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcnfP51944 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcnfP51944 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcnfP51944 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CcnfP51944 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CcnfP51944 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CcnfP51944 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CcnfP51944 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcnfP51944 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcnfP51944 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CcnfP51944 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnfP51944 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnfP51944 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CcnfP51944 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CcnfP51944 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CcnfP51944 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CcnfP51944 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CcnfP51944 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcnfP51944 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcnfP51944 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CcnfP51944 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CcnfP51944 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcnfP51944 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcnfP51944 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcnfP51944 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CcnfP51944 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CcnfP51944 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CcnfP51944 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CcnfP51944 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CcnfP51944 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CcnfP51944 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CcnfP51944 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CcnfP51944 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcnfP51944 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CcnfP51944 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CcnfP51944 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcnfP51944 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcnfP51944 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CcnfP51944 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcnfP51944 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcnfP51944 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcnfP51944 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CcnfP51944 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CcnfP51944 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms