Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccr5P51682 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccr5P51682 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccr5P51682 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccr5P51682 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccr5P51682 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccr5P51682 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccr5P51682 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccr5P51682 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccr5P51682 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccr5P51682 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccr5P51682 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccr5P51682 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccr5P51682 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccr5P51682 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccr5P51682 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccr5P51682 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccr5P51682 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccr5P51682 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccr5P51682 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccr5P51682 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccr5P51682 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccr5P51682 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccr5P51682 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccr5P51682 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccr5P51682 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccr5P51682 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccr5P51682 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccr5P51682 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccr5P51682 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccr5P51682 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccr5P51682 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccr5P51682 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccr5P51682 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccr5P51682 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccr5P51682 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccr5P51682 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccr5P51682 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccr5P51682 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccr5P51682 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccr5P51682 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccr5P51682 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccr5P51682 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccr5P51682 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccr5P51682 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccr5P51682 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccr5P51682 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccr5P51682 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccr5P51682 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccr5P51682 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccr5P51682 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccr5P51682 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccr5P51682 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccr5P51682 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccr5P51682 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccr5P51682 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccr5P51682 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccr5P51682 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccr5P51682 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccr5P51682 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccr5P51682 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccr5P51682 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccr5P51682 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccr5P51682 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccr5P51682 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccr5P51682 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccr5P51682 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccr5P51682 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccr5P51682 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccr5P51682 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccr5P51682 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccr5P51682 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccr5P51682 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccr5P51682 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccr5P51682 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccr5P51682 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccr5P51682 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccr5P51682 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccr5P51682 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccr5P51682 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccr5P51682 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccr5P51682 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccr5P51682 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccr5P51682 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccr5P51682 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccr5P51682 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccr5P51682 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccr5P51682 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccr5P51682 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccr5P51682 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccr5P51682 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccr5P51682 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccr5P51682 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccr5P51682 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccr5P51682 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccr5P51682 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccr5P51682 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccr5P51682 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccr5P51682 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccr5P51682 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms