Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpc4P51655 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpc4P51655 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc4P51655 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc4P51655 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc4P51655 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc4P51655 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc4P51655 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc4P51655 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc4P51655 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc4P51655 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc4P51655 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc4P51655 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc4P51655 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpc4P51655 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc4P51655 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc4P51655 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gpc4P51655 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpc4P51655 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpc4P51655 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc4P51655 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc4P51655 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc4P51655 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc4P51655 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpc4P51655 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc4P51655 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc4P51655 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpc4P51655 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc4P51655 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc4P51655 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpc4P51655 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc4P51655 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpc4P51655 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpc4P51655 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpc4P51655 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpc4P51655 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc4P51655 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpc4P51655 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc4P51655 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpc4P51655 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc4P51655 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpc4P51655 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms