Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tmod1P49813 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmod1P49813 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmod1P49813 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmod1P49813 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmod1P49813 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmod1P49813 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmod1P49813 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmod1P49813 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmod1P49813 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmod1P49813 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmod1P49813 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmod1P49813 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmod1P49813 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmod1P49813 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmod1P49813 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmod1P49813 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmod1P49813 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmod1P49813 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmod1P49813 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmod1P49813 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmod1P49813 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmod1P49813 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmod1P49813 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmod1P49813 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmod1P49813 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmod1P49813 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmod1P49813 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmod1P49813 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmod1P49813 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmod1P49813 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmod1P49813 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmod1P49813 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmod1P49813 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmod1P49813 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmod1P49813 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmod1P49813 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmod1P49813 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmod1P49813 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmod1P49813 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmod1P49813 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmod1P49813 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmod1P49813 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmod1P49813 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmod1P49813 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmod1P49813 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmod1P49813 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmod1P49813 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmod1P49813 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmod1P49813 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmod1P49813 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmod1P49813 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmod1P49813 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmod1P49813 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmod1P49813 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmod1P49813 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmod1P49813 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmod1P49813 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmod1P49813 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmod1P49813 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmod1P49813 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmod1P49813 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmod1P49813 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmod1P49813 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmod1P49813 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmod1P49813 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmod1P49813 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmod1P49813 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmod1P49813 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmod1P49813 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmod1P49813 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmod1P49813 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmod1P49813 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmod1P49813 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmod1P49813 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmod1P49813 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmod1P49813 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmod1P49813 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms