Protein–RNA interactions for Protein: P48316

Gadd45a, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45aP48316 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45aP48316 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gadd45aP48316 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gadd45aP48316 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gadd45aP48316 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gadd45aP48316 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gadd45aP48316 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gadd45aP48316 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gadd45aP48316 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gadd45aP48316 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gadd45aP48316 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gadd45aP48316 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gadd45aP48316 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gadd45aP48316 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gadd45aP48316 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gadd45aP48316 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gadd45aP48316 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gadd45aP48316 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gadd45aP48316 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gadd45aP48316 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gadd45aP48316 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gadd45aP48316 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gadd45aP48316 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gadd45aP48316 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gadd45aP48316 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gadd45aP48316 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gadd45aP48316 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gadd45aP48316 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms