Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CratP47934 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CratP47934 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CratP47934 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CratP47934 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CratP47934 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CratP47934 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CratP47934 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CratP47934 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CratP47934 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CratP47934 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CratP47934 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CratP47934 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CratP47934 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CratP47934 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CratP47934 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CratP47934 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CratP47934 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CratP47934 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CratP47934 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CratP47934 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CratP47934 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CratP47934 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CratP47934 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CratP47934 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CratP47934 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CratP47934 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CratP47934 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CratP47934 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CratP47934 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CratP47934 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CratP47934 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CratP47934 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CratP47934 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CratP47934 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CratP47934 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CratP47934 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CratP47934 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CratP47934 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CratP47934 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CratP47934 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CratP47934 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CratP47934 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CratP47934 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CratP47934 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CratP47934 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CratP47934 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CratP47934 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CratP47934 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CratP47934 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CratP47934 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CratP47934 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CratP47934 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CratP47934 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CratP47934 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CratP47934 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CratP47934 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CratP47934 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CratP47934 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CratP47934 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CratP47934 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CratP47934 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CratP47934 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CratP47934 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CratP47934 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CratP47934 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CratP47934 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CratP47934 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CratP47934 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CratP47934 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CratP47934 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CratP47934 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CratP47934 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CratP47934 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CratP47934 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CratP47934 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CratP47934 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CratP47934 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CratP47934 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CratP47934 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CratP47934 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CratP47934 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CratP47934 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CratP47934 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CratP47934 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CratP47934 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CratP47934 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CratP47934 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CratP47934 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CratP47934 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CratP47934 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CratP47934 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CratP47934 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CratP47934 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CratP47934 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CratP47934 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CratP47934 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CratP47934 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CratP47934 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CratP47934 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms