Protein–RNA interactions for Protein: P43352

Rad52, DNA repair protein RAD52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad52P43352 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad52P43352 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad52P43352 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad52P43352 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad52P43352 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad52P43352 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad52P43352 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad52P43352 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad52P43352 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad52P43352 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad52P43352 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad52P43352 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad52P43352 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad52P43352 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rad52P43352 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad52P43352 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad52P43352 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad52P43352 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad52P43352 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad52P43352 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad52P43352 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad52P43352 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad52P43352 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad52P43352 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad52P43352 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad52P43352 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad52P43352 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad52P43352 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad52P43352 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad52P43352 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rad52P43352 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad52P43352 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad52P43352 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad52P43352 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad52P43352 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad52P43352 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad52P43352 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad52P43352 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad52P43352 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad52P43352 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad52P43352 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad52P43352 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad52P43352 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad52P43352 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad52P43352 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad52P43352 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad52P43352 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad52P43352 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad52P43352 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad52P43352 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad52P43352 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad52P43352 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad52P43352 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad52P43352 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad52P43352 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad52P43352 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad52P43352 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad52P43352 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad52P43352 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad52P43352 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad52P43352 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad52P43352 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad52P43352 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad52P43352 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rad52P43352 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad52P43352 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad52P43352 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad52P43352 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad52P43352 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad52P43352 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad52P43352 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad52P43352 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad52P43352 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad52P43352 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad52P43352 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad52P43352 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad52P43352 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad52P43352 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad52P43352 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad52P43352 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad52P43352 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad52P43352 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad52P43352 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad52P43352 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad52P43352 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad52P43352 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad52P43352 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad52P43352 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad52P43352 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad52P43352 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad52P43352 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad52P43352 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad52P43352 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad52P43352 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad52P43352 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad52P43352 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad52P43352 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad52P43352 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad52P43352 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad52P43352 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms