Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ddit3P35639 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ddit3P35639 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ddit3P35639 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ddit3P35639 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ddit3P35639 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ddit3P35639 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ddit3P35639 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ddit3P35639 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ddit3P35639 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ddit3P35639 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ddit3P35639 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ddit3P35639 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ddit3P35639 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ddit3P35639 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ddit3P35639 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ddit3P35639 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ddit3P35639 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ddit3P35639 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ddit3P35639 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ddit3P35639 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ddit3P35639 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ddit3P35639 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ddit3P35639 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ddit3P35639 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ddit3P35639 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ddit3P35639 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ddit3P35639 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ddit3P35639 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ddit3P35639 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ddit3P35639 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ddit3P35639 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ddit3P35639 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ddit3P35639 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ddit3P35639 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ddit3P35639 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ddit3P35639 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ddit3P35639 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ddit3P35639 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ddit3P35639 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ddit3P35639 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ddit3P35639 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ddit3P35639 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ddit3P35639 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ddit3P35639 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ddit3P35639 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddit3P35639 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddit3P35639 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddit3P35639 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddit3P35639 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ddit3P35639 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ddit3P35639 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ddit3P35639 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ddit3P35639 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ddit3P35639 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ddit3P35639 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ddit3P35639 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ddit3P35639 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ddit3P35639 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ddit3P35639 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ddit3P35639 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ddit3P35639 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ddit3P35639 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ddit3P35639 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ddit3P35639 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ddit3P35639 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ddit3P35639 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ddit3P35639 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ddit3P35639 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ddit3P35639 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ddit3P35639 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ddit3P35639 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ddit3P35639 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ddit3P35639 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ddit3P35639 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ddit3P35639 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ddit3P35639 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ddit3P35639 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ddit3P35639 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ddit3P35639 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ddit3P35639 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ddit3P35639 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms