Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab23P35288 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab23P35288 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab23P35288 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab23P35288 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab23P35288 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab23P35288 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab23P35288 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab23P35288 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab23P35288 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab23P35288 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rab23P35288 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab23P35288 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab23P35288 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab23P35288 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab23P35288 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rab23P35288 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rab23P35288 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rab23P35288 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab23P35288 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab23P35288 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab23P35288 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rab23P35288 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab23P35288 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab23P35288 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab23P35288 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab23P35288 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab23P35288 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab23P35288 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab23P35288 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rab23P35288 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab23P35288 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab23P35288 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab23P35288 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rab23P35288 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rab23P35288 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab23P35288 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab23P35288 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab23P35288 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rab23P35288 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab23P35288 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab23P35288 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab23P35288 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab23P35288 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab23P35288 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab23P35288 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab23P35288 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rab23P35288 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rab23P35288 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rab23P35288 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab23P35288 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab23P35288 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rab23P35288 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab23P35288 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab23P35288 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab23P35288 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab23P35288 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab23P35288 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab23P35288 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab23P35288 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab23P35288 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab23P35288 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rab23P35288 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab23P35288 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab23P35288 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab23P35288 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab23P35288 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rab23P35288 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab23P35288 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab23P35288 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab23P35288 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rab23P35288 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab23P35288 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab23P35288 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rab23P35288 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab23P35288 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab23P35288 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab23P35288 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab23P35288 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab23P35288 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab23P35288 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab23P35288 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rab23P35288 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab23P35288 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rab23P35288 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rab23P35288 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab23P35288 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms