Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp12P34960 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp12P34960 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp12P34960 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp12P34960 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp12P34960 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp12P34960 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp12P34960 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp12P34960 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp12P34960 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp12P34960 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp12P34960 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp12P34960 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp12P34960 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp12P34960 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp12P34960 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp12P34960 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp12P34960 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp12P34960 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp12P34960 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp12P34960 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp12P34960 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp12P34960 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp12P34960 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp12P34960 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp12P34960 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp12P34960 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp12P34960 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp12P34960 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp12P34960 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp12P34960 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp12P34960 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp12P34960 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp12P34960 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp12P34960 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp12P34960 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp12P34960 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp12P34960 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp12P34960 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp12P34960 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp12P34960 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp12P34960 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp12P34960 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp12P34960 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp12P34960 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp12P34960 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp12P34960 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp12P34960 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp12P34960 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp12P34960 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp12P34960 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp12P34960 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp12P34960 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp12P34960 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp12P34960 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp12P34960 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp12P34960 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp12P34960 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp12P34960 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp12P34960 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp12P34960 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp12P34960 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mmp12P34960 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mmp12P34960 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp12P34960 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp12P34960 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp12P34960 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp12P34960 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp12P34960 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp12P34960 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp12P34960 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mmp12P34960 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp12P34960 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp12P34960 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp12P34960 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp12P34960 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mmp12P34960 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp12P34960 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mmp12P34960 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mmp12P34960 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp12P34960 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mmp12P34960 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms