Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mmp13P33435 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp13P33435 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp13P33435 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mmp13P33435 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mmp13P33435 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp13P33435 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp13P33435 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mmp13P33435 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp13P33435 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mmp13P33435 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp13P33435 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Mmp13P33435 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp13P33435 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mmp13P33435 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mmp13P33435 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp13P33435 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp13P33435 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp13P33435 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mmp13P33435 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp13P33435 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp13P33435 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp13P33435 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp13P33435 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mmp13P33435 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp13P33435 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp13P33435 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp13P33435 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp13P33435 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp13P33435 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp13P33435 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp13P33435 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp13P33435 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp13P33435 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp13P33435 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp13P33435 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp13P33435 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp13P33435 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp13P33435 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp13P33435 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp13P33435 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp13P33435 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp13P33435 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp13P33435 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp13P33435 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp13P33435 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp13P33435 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp13P33435 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp13P33435 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp13P33435 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp13P33435 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp13P33435 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp13P33435 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp13P33435 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms