Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdh15P33146 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdh15P33146 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdh15P33146 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdh15P33146 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdh15P33146 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdh15P33146 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdh15P33146 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdh15P33146 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdh15P33146 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdh15P33146 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdh15P33146 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdh15P33146 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdh15P33146 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdh15P33146 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdh15P33146 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdh15P33146 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdh15P33146 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdh15P33146 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdh15P33146 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdh15P33146 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdh15P33146 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdh15P33146 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdh15P33146 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdh15P33146 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdh15P33146 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdh15P33146 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdh15P33146 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdh15P33146 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdh15P33146 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdh15P33146 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdh15P33146 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdh15P33146 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdh15P33146 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdh15P33146 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdh15P33146 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdh15P33146 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdh15P33146 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdh15P33146 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdh15P33146 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdh15P33146 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdh15P33146 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdh15P33146 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdh15P33146 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdh15P33146 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdh15P33146 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdh15P33146 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdh15P33146 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdh15P33146 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdh15P33146 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdh15P33146 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdh15P33146 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdh15P33146 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdh15P33146 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdh15P33146 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdh15P33146 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdh15P33146 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdh15P33146 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdh15P33146 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdh15P33146 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdh15P33146 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdh15P33146 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdh15P33146 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdh15P33146 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdh15P33146 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdh15P33146 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdh15P33146 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdh15P33146 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdh15P33146 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdh15P33146 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdh15P33146 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdh15P33146 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdh15P33146 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdh15P33146 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdh15P33146 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdh15P33146 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms