Protein–RNA interactions for Protein: P29319

Epha3, Ephrin type-A receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha3P29319 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Epha3P29319 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Epha3P29319 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Epha3P29319 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Epha3P29319 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Epha3P29319 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Epha3P29319 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Epha3P29319 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Epha3P29319 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Epha3P29319 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Epha3P29319 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Epha3P29319 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Epha3P29319 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Epha3P29319 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Epha3P29319 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Epha3P29319 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Epha3P29319 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Epha3P29319 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Epha3P29319 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Epha3P29319 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Epha3P29319 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Epha3P29319 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Epha3P29319 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Epha3P29319 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Epha3P29319 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Epha3P29319 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Epha3P29319 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Epha3P29319 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Epha3P29319 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Epha3P29319 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Epha3P29319 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Epha3P29319 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Epha3P29319 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Epha3P29319 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Epha3P29319 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Epha3P29319 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Epha3P29319 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Epha3P29319 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Epha3P29319 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Epha3P29319 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Epha3P29319 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Epha3P29319 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Epha3P29319 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Epha3P29319 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Epha3P29319 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Epha3P29319 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Epha3P29319 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Epha3P29319 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Epha3P29319 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Epha3P29319 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Epha3P29319 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Epha3P29319 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Epha3P29319 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Epha3P29319 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Epha3P29319 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Epha3P29319 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Epha3P29319 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Epha3P29319 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Epha3P29319 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Epha3P29319 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Epha3P29319 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Epha3P29319 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Epha3P29319 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Epha3P29319 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Epha3P29319 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Epha3P29319 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Epha3P29319 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Epha3P29319 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Epha3P29319 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Epha3P29319 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Epha3P29319 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Epha3P29319 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Epha3P29319 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Epha3P29319 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Epha3P29319 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Epha3P29319 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Epha3P29319 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Epha3P29319 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Epha3P29319 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Epha3P29319 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Epha3P29319 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Epha3P29319 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Epha3P29319 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Epha3P29319 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Epha3P29319 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Epha3P29319 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Epha3P29319 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Epha3P29319 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Epha3P29319 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Epha3P29319 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Epha3P29319 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Epha3P29319 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Epha3P29319 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Epha3P29319 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Epha3P29319 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Epha3P29319 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Epha3P29319 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Epha3P29319 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Epha3P29319 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Epha3P29319 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms