Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mmp3P28862 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mmp3P28862 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mmp3P28862 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mmp3P28862 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Mmp3P28862 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mmp3P28862 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mmp3P28862 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mmp3P28862 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mmp3P28862 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mmp3P28862 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mmp3P28862 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mmp3P28862 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mmp3P28862 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mmp3P28862 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mmp3P28862 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mmp3P28862 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mmp3P28862 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mmp3P28862 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mmp3P28862 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mmp3P28862 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mmp3P28862 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mmp3P28862 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mmp3P28862 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mmp3P28862 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mmp3P28862 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mmp3P28862 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Mmp3P28862 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mmp3P28862 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mmp3P28862 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Mmp3P28862 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mmp3P28862 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mmp3P28862 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Mmp3P28862 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Mmp3P28862 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Mmp3P28862 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mmp3P28862 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mmp3P28862 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mmp3P28862 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mmp3P28862 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mmp3P28862 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mmp3P28862 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Mmp3P28862 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mmp3P28862 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Mmp3P28862 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Mmp3P28862 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mmp3P28862 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mmp3P28862 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mmp3P28862 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mmp3P28862 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mmp3P28862 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mmp3P28862 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mmp3P28862 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mmp3P28862 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Mmp3P28862 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mmp3P28862 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Mmp3P28862 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mmp3P28862 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Mmp3P28862 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Mmp3P28862 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mmp3P28862 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mmp3P28862 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mmp3P28862 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Mmp3P28862 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mmp3P28862 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mmp3P28862 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mmp3P28862 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mmp3P28862 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mmp3P28862 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Mmp3P28862 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mmp3P28862 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mmp3P28862 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Mmp3P28862 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mmp3P28862 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Mmp3P28862 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mmp3P28862 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Mmp3P28862 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mmp3P28862 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Mmp3P28862 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mmp3P28862 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mmp3P28862 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mmp3P28862 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mmp3P28862 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Mmp3P28862 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mmp3P28862 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mmp3P28862 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Mmp3P28862 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mmp3P28862 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mmp3P28862 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mmp3P28862 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mmp3P28862 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mmp3P28862 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mmp3P28862 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mmp3P28862 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mmp3P28862 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mmp3P28862 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mmp3P28862 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Mmp3P28862 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mmp3P28862 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mmp3P28862 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms