Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Aco1P28271 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Aco1P28271 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aco1P28271 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aco1P28271 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Aco1P28271 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aco1P28271 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Aco1P28271 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Aco1P28271 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Aco1P28271 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Aco1P28271 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Aco1P28271 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Aco1P28271 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Aco1P28271 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Aco1P28271 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Aco1P28271 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Aco1P28271 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Aco1P28271 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Aco1P28271 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Aco1P28271 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Aco1P28271 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Aco1P28271 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Aco1P28271 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Aco1P28271 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Aco1P28271 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Aco1P28271 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Aco1P28271 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Aco1P28271 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Aco1P28271 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Aco1P28271 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aco1P28271 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aco1P28271 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aco1P28271 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Aco1P28271 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aco1P28271 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aco1P28271 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aco1P28271 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Aco1P28271 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Aco1P28271 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Aco1P28271 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Aco1P28271 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Aco1P28271 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Aco1P28271 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Aco1P28271 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Aco1P28271 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Aco1P28271 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Aco1P28271 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Aco1P28271 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Aco1P28271 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Aco1P28271 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Aco1P28271 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Aco1P28271 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Aco1P28271 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Aco1P28271 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Aco1P28271 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Aco1P28271 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Aco1P28271 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Aco1P28271 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Aco1P28271 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Aco1P28271 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Aco1P28271 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Aco1P28271 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Aco1P28271 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Aco1P28271 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Aco1P28271 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Aco1P28271 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Aco1P28271 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Aco1P28271 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Aco1P28271 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Aco1P28271 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Aco1P28271 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Aco1P28271 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Aco1P28271 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Aco1P28271 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Aco1P28271 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Aco1P28271 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Aco1P28271 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Aco1P28271 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Aco1P28271 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Aco1P28271 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Aco1P28271 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Aco1P28271 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Aco1P28271 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Aco1P28271 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Aco1P28271 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Aco1P28271 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Aco1P28271 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Aco1P28271 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Aco1P28271 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Aco1P28271 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Aco1P28271 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Aco1P28271 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Aco1P28271 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Aco1P28271 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Aco1P28271 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Aco1P28271 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Aco1P28271 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Aco1P28271 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Aco1P28271 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Aco1P28271 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms