Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-DMaP28078 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-DMaP28078 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-DMaP28078 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-DMaP28078 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-DMaP28078 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-DMaP28078 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-DMaP28078 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-DMaP28078 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-DMaP28078 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-DMaP28078 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-DMaP28078 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-DMaP28078 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-DMaP28078 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-DMaP28078 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-DMaP28078 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-DMaP28078 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-DMaP28078 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-DMaP28078 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-DMaP28078 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-DMaP28078 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-DMaP28078 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-DMaP28078 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-DMaP28078 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-DMaP28078 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-DMaP28078 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-DMaP28078 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-DMaP28078 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-DMaP28078 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-DMaP28078 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-DMaP28078 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-DMaP28078 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms