Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bmi1P25916 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bmi1P25916 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bmi1P25916 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bmi1P25916 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bmi1P25916 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bmi1P25916 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bmi1P25916 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bmi1P25916 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bmi1P25916 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bmi1P25916 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bmi1P25916 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bmi1P25916 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bmi1P25916 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bmi1P25916 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bmi1P25916 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bmi1P25916 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bmi1P25916 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bmi1P25916 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bmi1P25916 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bmi1P25916 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bmi1P25916 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bmi1P25916 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bmi1P25916 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Bmi1P25916 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Bmi1P25916 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bmi1P25916 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bmi1P25916 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bmi1P25916 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bmi1P25916 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bmi1P25916 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bmi1P25916 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bmi1P25916 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bmi1P25916 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bmi1P25916 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bmi1P25916 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bmi1P25916 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bmi1P25916 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bmi1P25916 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bmi1P25916 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bmi1P25916 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bmi1P25916 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bmi1P25916 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bmi1P25916 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bmi1P25916 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bmi1P25916 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bmi1P25916 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bmi1P25916 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bmi1P25916 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bmi1P25916 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bmi1P25916 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bmi1P25916 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bmi1P25916 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bmi1P25916 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bmi1P25916 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bmi1P25916 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bmi1P25916 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bmi1P25916 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms