Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Htr3aP23979 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Htr3aP23979 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Htr3aP23979 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Htr3aP23979 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Htr3aP23979 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Htr3aP23979 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Htr3aP23979 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Htr3aP23979 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Htr3aP23979 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Htr3aP23979 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Htr3aP23979 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Htr3aP23979 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Htr3aP23979 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Htr3aP23979 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Htr3aP23979 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Htr3aP23979 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Htr3aP23979 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Htr3aP23979 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Htr3aP23979 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Htr3aP23979 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Htr3aP23979 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Htr3aP23979 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Htr3aP23979 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Htr3aP23979 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Htr3aP23979 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Htr3aP23979 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Htr3aP23979 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htr3aP23979 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htr3aP23979 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htr3aP23979 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htr3aP23979 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htr3aP23979 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htr3aP23979 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Htr3aP23979 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Htr3aP23979 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Htr3aP23979 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Htr3aP23979 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Htr3aP23979 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Htr3aP23979 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Htr3aP23979 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htr3aP23979 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htr3aP23979 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htr3aP23979 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htr3aP23979 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Htr3aP23979 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htr3aP23979 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htr3aP23979 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htr3aP23979 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Htr3aP23979 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Htr3aP23979 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Htr3aP23979 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Htr3aP23979 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Htr3aP23979 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htr3aP23979 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htr3aP23979 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Htr3aP23979 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Htr3aP23979 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Htr3aP23979 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Htr3aP23979 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Htr3aP23979 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Htr3aP23979 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Htr3aP23979 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htr3aP23979 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htr3aP23979 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Htr3aP23979 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htr3aP23979 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htr3aP23979 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htr3aP23979 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Htr3aP23979 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Htr3aP23979 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Htr3aP23979 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Htr3aP23979 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htr3aP23979 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htr3aP23979 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Htr3aP23979 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Htr3aP23979 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms