Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd12P23812 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd12P23812 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd12P23812 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd12P23812 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd12P23812 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxd12P23812 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxd12P23812 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd12P23812 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd12P23812 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd12P23812 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd12P23812 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd12P23812 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd12P23812 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd12P23812 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd12P23812 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd12P23812 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd12P23812 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd12P23812 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd12P23812 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxd12P23812 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd12P23812 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd12P23812 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd12P23812 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd12P23812 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd12P23812 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd12P23812 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd12P23812 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd12P23812 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd12P23812 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd12P23812 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd12P23812 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd12P23812 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxd12P23812 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd12P23812 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd12P23812 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd12P23812 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd12P23812 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd12P23812 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd12P23812 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxd12P23812 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxd12P23812 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxd12P23812 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd12P23812 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd12P23812 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd12P23812 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd12P23812 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd12P23812 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxd12P23812 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd12P23812 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd12P23812 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd12P23812 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd12P23812 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd12P23812 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxd12P23812 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxd12P23812 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxd12P23812 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms