Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edn1P22387 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edn1P22387 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edn1P22387 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Edn1P22387 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Edn1P22387 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Edn1P22387 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edn1P22387 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edn1P22387 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Edn1P22387 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edn1P22387 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Edn1P22387 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edn1P22387 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edn1P22387 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edn1P22387 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edn1P22387 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edn1P22387 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edn1P22387 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edn1P22387 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edn1P22387 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms