Protein–RNA interactions for Protein: P22005

Penk, Proenkephalin-A, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PenkP22005 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PenkP22005 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PenkP22005 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PenkP22005 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PenkP22005 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PenkP22005 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PenkP22005 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PenkP22005 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PenkP22005 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PenkP22005 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PenkP22005 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PenkP22005 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PenkP22005 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PenkP22005 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PenkP22005 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PenkP22005 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PenkP22005 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PenkP22005 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PenkP22005 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PenkP22005 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PenkP22005 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PenkP22005 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PenkP22005 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PenkP22005 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PenkP22005 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PenkP22005 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PenkP22005 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PenkP22005 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PenkP22005 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PenkP22005 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PenkP22005 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PenkP22005 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PenkP22005 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PenkP22005 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PenkP22005 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PenkP22005 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PenkP22005 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PenkP22005 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PenkP22005 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PenkP22005 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PenkP22005 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PenkP22005 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PenkP22005 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PenkP22005 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PenkP22005 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PenkP22005 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PenkP22005 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PenkP22005 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PenkP22005 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PenkP22005 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PenkP22005 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PenkP22005 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PenkP22005 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PenkP22005 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PenkP22005 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PenkP22005 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PenkP22005 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PenkP22005 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PenkP22005 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PenkP22005 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PenkP22005 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PenkP22005 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PenkP22005 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PenkP22005 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PenkP22005 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PenkP22005 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PenkP22005 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PenkP22005 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PenkP22005 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PenkP22005 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PenkP22005 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PenkP22005 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PenkP22005 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PenkP22005 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PenkP22005 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PenkP22005 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PenkP22005 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PenkP22005 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PenkP22005 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PenkP22005 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PenkP22005 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PenkP22005 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PenkP22005 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PenkP22005 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PenkP22005 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PenkP22005 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PenkP22005 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PenkP22005 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PenkP22005 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PenkP22005 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PenkP22005 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PenkP22005 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PenkP22005 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PenkP22005 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PenkP22005 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PenkP22005 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PenkP22005 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PenkP22005 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PenkP22005 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PenkP22005 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms