Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ntf3P20181 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ntf3P20181 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ntf3P20181 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ntf3P20181 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ntf3P20181 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms