Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl13aP19253 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl13aP19253 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl13aP19253 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl13aP19253 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl13aP19253 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl13aP19253 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl13aP19253 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl13aP19253 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl13aP19253 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl13aP19253 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl13aP19253 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl13aP19253 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13aP19253 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13aP19253 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13aP19253 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13aP19253 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl13aP19253 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl13aP19253 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl13aP19253 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl13aP19253 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms