Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptbp1P17225 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ptbp1P17225 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptbp1P17225 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptbp1P17225 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptbp1P17225 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ptbp1P17225 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ptbp1P17225 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptbp1P17225 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptbp1P17225 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptbp1P17225 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptbp1P17225 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptbp1P17225 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptbp1P17225 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptbp1P17225 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptbp1P17225 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptbp1P17225 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptbp1P17225 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptbp1P17225 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptbp1P17225 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms