Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp53P15975 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp53P15975 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp53P15975 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp53P15975 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp53P15975 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp53P15975 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp53P15975 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp53P15975 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp53P15975 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp53P15975 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp53P15975 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp53P15975 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp53P15975 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp53P15975 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp53P15975 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp53P15975 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp53P15975 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp53P15975 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp53P15975 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp53P15975 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp53P15975 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp53P15975 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp53P15975 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp53P15975 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp53P15975 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp53P15975 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp53P15975 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp53P15975 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp53P15975 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp53P15975 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp53P15975 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp53P15975 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp53P15975 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp53P15975 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp53P15975 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp53P15975 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp53P15975 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp53P15975 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp53P15975 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp53P15975 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp53P15975 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp53P15975 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp53P15975 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp53P15975 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp53P15975 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp53P15975 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp53P15975 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp53P15975 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp53P15975 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Usp53P15975 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Usp53P15975 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp53P15975 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp53P15975 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp53P15975 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp53P15975 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp53P15975 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp53P15975 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp53P15975 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp53P15975 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp53P15975 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp53P15975 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp53P15975 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp53P15975 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp53P15975 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp53P15975 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp53P15975 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp53P15975 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp53P15975 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp53P15975 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp53P15975 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp53P15975 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp53P15975 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp53P15975 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp53P15975 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp53P15975 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp53P15975 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp53P15975 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp53P15975 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp53P15975 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp53P15975 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp53P15975 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp53P15975 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp53P15975 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp53P15975 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp53P15975 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp53P15975 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp53P15975 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp53P15975 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Usp53P15975 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp53P15975 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp53P15975 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms