Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trim30aP15533 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim30aP15533 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim30aP15533 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim30aP15533 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim30aP15533 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim30aP15533 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim30aP15533 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim30aP15533 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim30aP15533 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim30aP15533 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim30aP15533 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim30aP15533 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim30aP15533 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim30aP15533 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim30aP15533 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim30aP15533 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim30aP15533 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim30aP15533 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim30aP15533 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim30aP15533 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim30aP15533 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim30aP15533 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim30aP15533 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim30aP15533 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim30aP15533 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim30aP15533 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim30aP15533 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim30aP15533 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim30aP15533 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim30aP15533 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim30aP15533 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim30aP15533 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim30aP15533 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim30aP15533 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim30aP15533 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim30aP15533 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim30aP15533 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim30aP15533 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim30aP15533 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim30aP15533 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim30aP15533 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim30aP15533 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim30aP15533 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim30aP15533 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim30aP15533 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim30aP15533 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim30aP15533 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim30aP15533 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim30aP15533 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim30aP15533 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim30aP15533 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim30aP15533 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim30aP15533 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim30aP15533 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim30aP15533 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim30aP15533 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim30aP15533 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim30aP15533 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim30aP15533 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim30aP15533 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim30aP15533 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim30aP15533 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim30aP15533 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms